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Serveur Web ESPript/ENDscript

Le serveur ESPript/ENDscript permet d’obtenir une large palette d’information 1D, 2D et 3D à partir d’une protéine de structure connue. Un fichier de coordonnées PDB peut être donné en entrée à ENDscript, qui utilise BLAST pour chercher des séquences homologues dans les banques de données UniProt ou PDBaa. Ces séquences sont ensuite alignées avec CLUSTAL. Puis, l’information de structure secondaire des séquences de protéines homologues de structure connue sont extraites avec DSSP et des fichiers images et PostScript sont créés grâce aux programmes ESPript et BobScript.

Site Web : http://endscript.ibcp.fr/

Contact : p.gouet@ibcp.fr