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Modélisation des Macromolécules Biologiques (L. Monticelli)

Notre recherche est centrée sur la bioinformatique structurale et cible une meilleure compréhension des liens entre séquence, structure, interaction et, à terme, des fonctions biologiques à l’échelle moléculaire. Pour atteindre ce but, nous avons premièrement besoin d’accéder à une gamme importante d’informations biologiques (séquences génomiques, séquences protéiques, structures des protéines et de leurs assemblages, informations mutationnelles et pathologiques, ...) que nous pouvons enrichir par l’annotation au sens large (identification d’homologies, prédictions structurales, identification de fonction, …). Deuxièmement, nous exploitons de multiples outils théoriques existants, tout en mettant au point de nouveaux outils pour résoudre des problèmes auxquels nous sommes confrontés. Ces deux facettes de notre recherche s’appuient sur l’accès aux moyens computationnels appropriés, non seulement pour nos propres études, mais aussi pour mettre les informations qui en découlent à la disposition de la communauté internationale des biologistes (notamment à travers le services web du Pôle Bioinformatique Rhône-Alpin, le PRABI). Dans ce but, nous maintenons des moyens informatiques efficaces au sein du laboratoire, mais nous avons également recours aux grilles et aux superordinateurs. Nos recherches actuelles portent, entre autres, sur le virus de l’hépatite C (nous maintenons la base de données européenne correspondante euHCVdb), la conception de nouvelles molécules d’intérêt pharmacologique ciblant des kinases humaines et bactériennes et, plus généralement, une meilleure compréhension de la structure, de la dynamique, de la stabilité et des interactions des protéines.

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