IBCP : Institute of Biology and Chemistry of Proteins - FR3302

La plateforme "Infrastructure Distribuée pour la Biologie" traite des problématiques de calcul scientifique en Biologie associées aux Infrastructures de Recherche qui se mettent en place au niveau national (RENABI, Institut des Grilles, …) et international (ELIXIR, …) : bioinformatique à grande échelle, données de grande taille, interfaces scientifiques web, grille et cloud computing. 

Depuis 2001, nous avons participé à plusieurs projets européens d’infrastructures informatiques distribuées impliquant la biologie comme domaine d’application scientifique, dont notamment le réseau d’excellence européen EMBRACE (www.embracegrid.info) et les projets EGEE-1, -2 et -3 (www.eu-egee.org). Depuis 2008, nous coordonnons au niveau national, dans le cadre de l’appel d’offre IBISA, le réseau de grille de calcul pour la biologie RENABI GRISBI (Grille, Support pour la Bioinformatique - www.grisbio.fr) entre neuf centres de Bioinformatique, collaborant dans le cadre du réseau RENABI (www.renabi.fr). L’objectif est de bâtir une infrastructure bioinformatique distribuée, au service de la communauté scientifique nationale. GRISBI a obtenu plusieurs soutiens : par le GIS IBISA (coordination nationale des Infrastructures en Biologie, Santé et Agronomie), qui a labellisé la plateforme GRISBI en 2008, et par l’Institut des Grilles du CNRS.

La plateforme IDB est actuellement impliquée dans les projets européen StratusLab (EU FP7, 2010-2012, www.stratuslab.eu) et national MapReduce (ANR ARPEGE, 2010-2013, mapreduce.inria.fr).